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弘光二十二年四月二十九日，朱由崧根據王夫之的意見，指示南京禮部更定大明歷代先帝的廟號和諡號。
對於朱由崧的指示，朝野議論紛紛，有人猜測朱由崧此舉是為將來自己的廟號留出可操作的餘地，有人則以為朱由崧這是借著褒貶先帝而拔高自己的歷史地位。
但不管是哪種原因，當今皇帝的指示是不能不落實的，所以當年五月十一日，禮部便向朱由崧遞交了修訂後的先帝廟號和諡號。
隨即朱由崧將禮部的修訂結果，發禮科審核，五月十七日，禮科奏報【妥當】，朱由崧遂明發天下。
說起來，禮部改動的本朝先帝廟號、諡號其實不多，主要是：給恭閔惠皇帝上廟號【顯宗】、把成祖文皇帝的廟號改回了【太宗】、把代宗景皇帝的廟號改為了【獻宗】、把神宗顯皇帝的廟號和諡號改為【高宗靖皇帝】、把老福王的廟號和諡號改為【元宗懿皇帝】。
於是乎，朱由崧以前的大明的先帝們的廟號諡號依次為：
太祖高皇帝→顯宗惠皇帝→太宗文皇帝→仁宗昭皇帝→宣宗章皇帝→英宗睿皇帝→獻宗景皇帝→英宗睿皇帝→憲宗純皇帝→孝宗敬皇帝→武宗毅皇帝→世宗肅皇帝→穆宗莊皇帝→高宗靖皇帝→光宗貞皇帝→熹宗悊皇帝→毅宗烈皇帝；
此外，大明到現在還有三位身前沒有當過一天皇帝、死後被追尊為皇帝的，分別是興宗康皇帝（懿文太子）、睿宗獻皇帝（興獻王）、元宗懿皇帝（福忠王）······
「關於太子登基後的年號，禮部議定了嗎？」
禮部尚書李永茂出列報告道：「回陛下的話，禮部已經議定【治祥】、【興泰】、【隆緒】、【鹹泰】、【慶順】等十二個年號備選，還請陛下和太子選定。」
李永茂隨即補充道：「【治祥】之【治】乃治平之意，前宋鄴雍有詩雲【榮逢平治日，天監表門閭】；【治祥】之【祥】乃傳也，前宋趙湘有詩雲【祥有時數，元極則傳】······」
李永茂絮絮叨叨的說了近40分鍾，朱由崧聽得有些頭暈不已，便在李永茂退下後，對身邊的朱慈焈說道：「一帝一元之後，年號幾為皇帝之象征，既然是吾兒做皇帝，年號自然就該吾兒自己來定，且仔細考量一二，不過也別想的太久了，畢竟太仆寺和禦用監稍後要製作年號錢，吾兒一登基，就要發行天下的！」
朱慈焈推辭道：「還是父皇定吧，年號而已，兒臣無不可！」
朱由崧笑了笑：「朕意已決，吾兒不必推辭了。」
說完年號的事後，宗人府宗人、遂平公主駙馬、石泉縣伯齊贊元出列奏報：「為賀陛下六十聖壽，邢、邾、周、唐、淮、益等藩藩主請求入朝朝賀。」
理藩院院使吳之屏也出列奏報道：「邊緣內藩並新封功藩，暹羅、真臘、蘇祿、文萊、占城、朝鮮、和國等十餘外藩也請旨入朝朝賀！」
吳之屏口中的邊緣內藩實際指的是西南舊有土司，對此朱由崧考慮再三，回復道：「同意各藩入朝朝賀。」
在吳之屏和齊贊元退回行列的時候，朱由崧對身邊站著東廠提督曹青輕鬆交代道：「等和國使團入境後，全程盯緊了，不可讓其有竊取步銃、線膛炮、蒸汽機等機密之可能，更不準任何文字流出大明！」
曹青應道：「奴婢明白該怎麼做了！」